โครงการพัฒนาห้องสมุดสีเขียว ดำเนินงานตามมาตรฐานการพัฒนาห้องสมุดสีเขียว พ.ศ.2558 โดยเลือกวิธีที่สะดวกและเหมาะสมกับสถานที่ทำงาน จึงประยุกต์ใช้ถังขยะที่มีนำมาจัดไว้สำหรับทิ้งขยะอันตรายภายในอาคารสำนักหอสมุด เพื่อการจัดการอย่างถูกวิธี และจัดส่งกำจัดกับมหาวิทยาลัยนเรศวร ปีละ 1 ครั้ง